mac下通过终端运行conda 环境中的deeptools,出现如下的报错:

ImportError: dlopen(/miniconda3/envs/deeptools/lib/python3.7/site-packages/pysam/libcutils.cpython-37m-darwin.so, 2): Library not loaded: @rpath/libcsamtools.cpython-37m-darwin.so
  Referenced from: /miniconda3/envs/deeptools/lib/python3.7/site-packages/pysam/libcutils.cpython-37m-darwin.so
  Reason: image not found

担心在base环境中,deeptools与其它软件包出现冲突,因此重新创建了独立的虚拟环境,安装deeptools后,仍然出现同样的报错;

重现安装或者升级pysam包,均未能解决问题。
参考:https://www.biostars.org/p/202965/
尝试降级pysam包,

$ conda install pysam==0.8.4

最终在低版本python=2.7.16的环境中,pysam包降级至0.8.4,安装deeptools=2.5.7成功

文章来源于互联网,如有雷同请联系站长删除:Mac系统Conda下运行deeptools报错的解决方案

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