解决方法

install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(c("AnnotationDbi", "impute","GO.db", "preprocessCore"))
site="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"
install.packages(c("WGCNA", "stringr", "reshape2"), repos=site)

上述代码在安装时报错,说什么3.5版本及以上的R才可以,问题是我装的4.0的R。
查了各种安装方式,安装包的时候时跳向系统用户目录,巧在系统用户是中文,报错理所应当,但是我明明修改了包安装的路径为D盘呢,查阅资料:原因在于未以管理员权限打开R。以管理员权限运行,完美运行。

报go.db缺失:
错误: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("GO.db")

文章来源于互联网,如有雷同请联系站长删除:R 安装WGCNA报缺失”GO.db”,手动安装go.db报4.0不支持go.db

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